Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms