Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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