Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.2 ms