Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FRMPD4Q14CM0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms