Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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