Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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