Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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