Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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