Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC1Q13547 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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