Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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