Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms