Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms