Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
OC90Q02509 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
OC90Q02509 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms