Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BNC1Q01954 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BNC1Q01954 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms