Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms