Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms