Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms