Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX1P83916 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX1P83916 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX1P83916 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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