Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms