Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms