Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTBP2P56545 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms