Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSEN2P49810 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms