Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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