Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms