Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms