Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR1P24390 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR1P24390 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms