Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRDP23468 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PTPRDP23468 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PTPRDP23468 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PTPRDP23468 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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