Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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