Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms