Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms