Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TMEM225BP0DP42 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TMEM225BP0DP42 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms