Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRCP08575 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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