Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms