Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAB2O43741 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms