Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms