Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms