Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SOBPA7XYQ1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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