Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms