Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT52Q9Y366 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms