Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAN1Q9Y2M0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms