Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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