Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCSER1Q9C0I3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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