Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms