Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC13A1Q9BZW2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC13A1Q9BZW2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms