Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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