Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms