Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TINF2Q9BSI4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms