Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms