Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PMCHL2Q9BQD1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.5 ms