Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TSPAN18Q96SJ8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms